Karbapeneemile resistentse Hypervi kliinilised ja molekulaarsed omadused

Javascript on praegu teie brauseris keelatud.Kui javascript on keelatud, ei tööta mõned selle veebisaidi funktsioonid.
Registreerige oma konkreetsed andmed ja konkreetsed huvipakkuvad ravimid ning me ühendame teie esitatud teabe meie ulatuslikus andmebaasis olevate artiklitega ja saadame teile õigeaegselt e-posti teel PDF-koopia.
Karbapeneemi suhtes resistentse kõrge virulentsusega Klebsiella pneumoniae kliinilised ja molekulaarsed omadused Shanghai kolmanda taseme haiglas
Zhou Cong, 1 Wu Qiang, 1 He Leqi, 1 Zhang Hui, 1 Xu Maosuo, 1 Bao Yuyuan, 2 Jin Zhi, 3 Fang Shen 11 Kliinilise laboratoorse meditsiini osakond, Shanghai 5. rahvahaigla, Fudani ülikool, Shanghai, Rahvavabariik Hiina;2 Shanghai Jiaotongi laboratoorse meditsiini osakond, Shanghai lastehaigla, Shanghai, Hiina Rahvavabariik;3 Fudani ülikooli Shanghai viies rahvahaigla neuroloogiaosakond. Vastav autor: Fang Shen, Fudani ülikooli Shanghai viienda rahvahaigla kliinilise laborimeditsiini osakond, nr 128 Ruili Road, Minhangi piirkond, Shanghai, Hiina sihtnumber 200240Tel +86 1802110733 E-post [email protected] Taust: Klebsiella pneumoniae karbapeneemi resistentsuse ja hüpervirulentsuse sulandumine on toonud kaasa suuri rahvatervise probleeme.Viimastel aastatel on üha rohkem teateid karbapeneemi suhtes resistentsete kõrge virulentsusega Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) isolaatide kohta.Materjalid ja meetodid: CR-hvKP-ga nakatunud patsientide kliiniliste andmete hindamise retrospektiivne analüüs 2019. aasta jaanuarist 2020. aasta detsembrini kolmanda taseme haiglas.Arvutage 2 aasta jooksul kogutud Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae (hmKP), karbapeneemresistentne Klebsiella pneumoniae (CR-hmKP) ja karbapeneemresistentne kõrge virulentsusega kopsupõletik. Leberella (CR-hvKP) isolaatide arv.CR-hvKP isolaatide resistentsusgeenide, virulentsusega seotud geenide, kapsli serotüübi geenide ja mitme lookuse järjestuse tüpiseerimine (MLST) PCR tuvastamine.Tulemused: Uuringu käigus eraldati kokku 1081 mittekorduvat Klebsiella pneumoniae tüve., Sealhulgas 392 Klebsiella pneumoniae tüve (36,3%), 39 CR-hmKP tüve (3,6%) ja 16 CR-hvKP tüve (1,5%).2019. aastal eraldatakse ligikaudu 31,2% (5/16) CR-hvKP-st ja 2020. aastal ligikaudu 68,8% (11/16) CR-hvKP-st. 16 CR-hvKP tüve hulgas on 13 tüve ST11 ja serotüüp K64, 1 tüvi on ST11 ja K47 serotüübid, 1 tüvi on ST23 ja K1 serotüübid ning 1 tüvi on ST86 ja K2 serotüübid.Virulentsusega seotud geenid entB, fimH, rmpA2, iutA ja iucA esinevad kõigis 16 CR-hvKP isolaadis, millele järgnevad mrkD (n=14), rmpA (n=13), aerobaktiin (n=2) , AllS ( n=1).Kõik 16 CR-hvKP isolaati kannavad karbapenemaasi geeni blaKPC-2 ja laiendatud spektriga β-laktamaasi geeni blaSHV.ERIC-PCR DNA sõrmejälgede võtmise tulemused näitasid, et 16 CR-hvKP tüve olid väga polümorfsed ja iga tüve ribad olid oluliselt erinevad, näidates sporaadilist olekut.Järeldus: kuigi CR-hvKP-d levitatakse juhuslikult, suureneb see aasta-aastalt.aastal.Seetõttu tuleks äratada kliiniline tähelepanu ja võtta vajalikke meetmeid, et vältida superbakteri CR-hvKP kloonimist ja levikut.Märksõnad: Klebsiella pneumoniae, karbapeneemi resistentsus, kõrge virulentsus, kõrge limasisaldus, epidemioloogia
Klebsiella pneumoniae on oportunistlik patogeen, mis võib põhjustada mitmesuguseid infektsioone, sealhulgas kopsupõletikku, kuseteede infektsioone, baktereemiat ja meningiiti.1 Viimase kolmekümne aasta jooksul on erinevalt klassikalisest Klebsiella pneumoniae (cKP) uuest väga virulentsest Klebsiella pneumoniae (hvKP) hüpermukoossest limast saanud kliiniliselt oluline patogeen, mida võib leida tervetel inimestel. ja immuunpuudulikkusega isikud.2 Väärib märkimist, et nende infektsioonidega kaasnevad tavaliselt destruktiivsed levinud infektsioonid, sealhulgas endoftalmiit ja meningiit.3 Limaskesta limaskesta kõrge fenotüübi hvKP tootmine on tavaliselt tingitud kapslite polüsahhariidide suurenenud tootmisest ja spetsiifiliste virulentsusgeenide, nagu rmpA ja rmpA2.4, olemasolust.Kõrge lima fenotüüp määratakse tavaliselt "stringi testiga".Üleöö vereagarplaatidel kasvanud Klebsiella pneumoniae kolooniad venitatakse aasaga.Kui moodustub viskoosne köis pikkusega >5mm, on “köiekatse” positiivne.5 Hiljutine uuring näitas, et peg-344, iroB, iucA, rmpA rmpA2 ja rmpA2 on biomarkerid, mis suudavad hvkp-d täpselt tuvastada.6 Selles uuringus määratleti väga virulentne Klebsiella pneumoniae kui kõrge lima viskoosse fenotüübiga (positiivne stringi testi tulemus) ja Klebsiella pneumoniae virulentsuse plasmiidiga seotud saitidel (rmpA2, iutA, iucA). 1980. aastatel kirjeldati Taiwani juhtumite kogukonda esmakordselt. - omandatud maksa abstsessid, mis on põhjustatud hvKP-st, millega kaasneb tõsine elundi lõppkahjustus, nagu meningiit ja endoftalmiit.7,8 hvKP levib sporaadiliselt paljudes Aasia, Euroopa ja Ameerika riikides.Kuigi Euroopas ja Ameerikas on teatatud mitmest hvKP juhtumist, esines hvKP levimus peamiselt Aasia riikides, eriti Hiinas.9
Üldiselt on hvKP antibiootikumide suhtes tundlikum, samas kui karbapeneemi suhtes resistentne Klebsiella pneumoonia (CRKP) on vähem toksiline.Ravimiresistentsuse ja virulentsuse plasmiidide leviku tõttu kirjeldasid CR-hvKP-d esmakordselt Zhang et al.2015. aastal ning kodumaiseid teateid on järjest rohkem.10 Kuna CR-hvKP võib põhjustada tõsiseid ja raskesti ravitavaid infektsioone, võib pandeemia klooni ilmnemisel saada järgmiseks "superbugiks".Praeguseks on enamik CR-hvKP põhjustatud nakkusi esinenud juhuslikult ja väikesemahulised puhangud on haruldased.11,12
Praegu on CR-hvKP tuvastamise määr madal ja sellega seotud uuringuid on vähe.CR-hvKP molekulaarne epidemioloogia on erinevates piirkondades erinev, mistõttu on vaja uurida CR-hvKP kliinilist levikut ja molekulaarseid epidemioloogilisi omadusi selles piirkonnas.Selles uuringus analüüsiti põhjalikult CR-hvKP resistentsuse geene, virulentsusega seotud geene ja MLST-d.Püüdsime uurida CR-hvKP levimust ja molekulaarset epidemioloogiat Ida-Hiinas Shanghais asuvas kolmanda taseme haiglas.See uuring on väga oluline CR-hvKP molekulaarse epidemioloogia mõistmiseks Shanghais.
Fudani ülikooliga seotud Shanghai viienda rahvahaigla mittekorduvad Klebsiella pneumoniae isolaadid 2019. aasta jaanuarist kuni 2020. aasta detsembrini koguti tagasiulatuvalt ning arvutati hmKP, CRKP, CR-hmkp ja CR-hvKP protsendid.Kõik isolaadid tuvastati kompaktse automaatse mikroobianalüsaatoriga VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, Prantsusmaa).Bakteritüvede identifitseerimise uuesti kontrollimiseks kasutati Maldi-Tofi massispektromeetriat (Bruker Daltonics, Billerica, MA, USA).Kõrge lima fenotüüp määratakse "stringi testiga".Kui imipeneem või meropeneem on resistentne, määratakse karbapeneemi resistentsus ravimitundlikkuse testiga.Väga virulentne Klebsiella pneumoniae on määratletud kui kõrge lima fenotüübiga (positiivne stringi testi tulemus) ja Klebsiella pneumoniae virulentsuse plasmiidiga seotud saitidel (rmpA2, iutA, iucA)6.
Üks Klebsiella pneumoniae koloonia inokuleeriti 5% lambavere agarplaadile.Pärast üleöö inkubeerimist 37 °C juures tõmmake koloonia õrnalt inokuleerimissilmusega üles ja korrake 3 korda.Kui viskoosne joon moodustub kolm korda ja pikkus on suurem kui 5 mm, loetakse "joontest" positiivseks ja tüvel on kõrge lima fenotüüp.
Kompaktses automaatses mikroobianalüsaatoris VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, Prantsusmaa) tuvastati puljongi mikrolahjenduse abil antimikroobne tundlikkus mitmele sagedamini kasutatavale antibiootikumile.Tulemusi tõlgendatakse vastavalt kliiniliste ja laboratoorsete standardite instituudi (CLSI, 2019) väljatöötatud juhenddokumendile.Antimikroobse tundlikkuse testimisel kasutati kontrollidena E. coli ATCC 25922 ja Klebsiella pneumoniae ATCC 700603.
Kõigi Klebsiella pneumoniae isolaatide genoomne DNA ekstraheeriti TIANamp Bacteria Genomic DNA Kitiga (Tiangen Biotech Co. Ltd., Peking, Hiina).Laiendatud spektriga β-laktamaasi geenid (blaCTX-M, blaSHV ja blaTEM), karbapenemaasi geenid (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaIMP ja blaOXA-48) ja 9 tüüpilist virulentsusega seotud geeni, sealhulgas pLVPK plasmiiditaolised lookused (allS, fimH) , mrkD, entB, iutA, rmpA, rmpA2, iucA ja aerobaktiini) amplifitseeriti PCR-ga, nagu eelnevalt kirjeldatud.13,14 kapsli serotüübispetsiifilist geeni (K1, K2, K5, K20, K54 ja K57) amplifitseeriti PCR-ga, nagu ülalpool kirjeldatud.14 Kui see on negatiivne, võimendage ja sekveneerige wzi lookust, et määrata kapsli serotüübispetsiifilised geenid.15 Selles uuringus kasutatud praimerid on loetletud tabelis S1.Positiivsed PCR-produktid sekveneeriti NextSeq 500 sekveneerimisplatvormi abil (Illumina, San Diego, CA, USA).Võrrelge nukleotiidjärjestusi, käivitades BLAST-i NCBI veebisaidil (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).
Mitme saidi järjestuse tüpiseerimine (MLST) viidi läbi nii, nagu on kirjeldatud Pasteuri Instituudi MLST veebisaidil (//bigsdb.pasteur.fr/klebsiella/klebsiella.html).Seitse majapidamisgeeni gapA, infB, mdh, pgi, phoE, rpoB ja tonB amplifitseeriti PCR-ga ja sekveneeriti.Järjestuse tüüp (ST) määratakse sekveneerimistulemuste võrdlemisel MLST andmebaasiga.
Analüüsiti Klebsiella pneumoniae homoloogiat.Klebsiella pneumoniae genoomne DNA ekstraheeriti matriitsina ja ERIC praimerid on näidatud tabelis S1.PCR võimendab genoomset DNA-d ja konstrueerib genoomse DNA sõrmejälje.2% agaroosgeelelektroforeesiga tuvastati 16 PCR produkti.DNA sõrmejälgede võtmise tulemused tuvastati tarkvara QuantityOne ribatuvastuse abil ja geneetiline analüüs viidi läbi aritmeetilise keskmise kaalumata paaritud grupi meetodil (UPGMA).Isolaadid, mille sarnasus on > 75%, loetakse samaks genotüübiks ja need, mille sarnasus on <75%, loetakse erinevateks genotüüpideks.
Kasutage andmete analüüsimiseks statistilist tarkvarapaketti SPSS for Windows 22.0.Andmeid kirjeldatakse kui keskmine ± standardhälve (SD).Kategoorilisi muutujaid hinnati hii-ruuttesti või Fisheri täpse testiga.Kõik statistilised testid on kaheosalised ja P väärtust <0,05 peetakse statistiliselt oluliseks.
Fudani ülikooliga seotud Shanghai viies rahvahaigla kogus ajavahemikus 1. jaanuarist 2019 kuni 31. detsembrini 2020 1081 Klebsiella pneumoniae isolaati ja välistas sama patsiendi dubleerivad isolaadid.Nende hulgas oli 392 tüve (36,3%) hmKP, 341 tüve (31,5%) CRKP, 39 tüve (3,6%) CR-hmKP ja 16 tüve (1,5%) CR-hvKP.Väärib märkimist, et CR-hmKP-st 33,3% (13/39) ja CR-hvKP-st 31,2% (5/16) on pärit 2019. aastast, 66,7% (26/39) CR-hmKP-st ja 68,8% (11/16) ) CR-hvKP eraldati 2020. aastast. Rögast (17 tüve), uriinist (12 tüve), drenaaživedelikust (4 tüve), verest (2 tüve), mädast (2 tüve), sapist (1 isolatsioon) ja pleuraefusioonist (vastavalt 1 isolatsioon).Kuusteist tüüpi CR-hvKP saadi rögast (9 isolaati), uriinist (5 isolaati), verest (1 isolaat) ja pleuraefusioonist (1 isolaat).
Tüve identifitseerimise, ravimitundlikkuse testi, stringi testi ja virulentsusega seotud geenide tuvastamise kaudu skriiniti 16 CR-hvKP tüve.CR-hvKP isolaatidega nakatunud 16 patsiendi kliinilised omadused on kokku võetud tabelis 1. 16 patsiendist 13 (81,3%) olid mehed ja kõik patsiendid olid vanemad kui 62 aastat (keskmine vanus: 83,1±10,5 aastat).Nad tulid 8 palatist ja üle poole kesksest intensiivraviosakonnast (9 juhtu).Põhihaiguste hulka kuuluvad ajuveresoonkonna haigused (75%, 12/16), hüpertensioon (50%, 8/16), krooniline obstruktiivne kopsuhaigus (50%, 8/16) jne. Invasiivne kirurgia hõlmab mehhaanilist ventilatsiooni (62,5%, 10/ 16), kuseteede kateeter (37,5%, 6/16), maosond (18,8%, 3/16), kirurgia (12,5%, 2/16) ja intravenoosne kateeter (6,3%, 1/16).16 patsiendist üheksa suri ja 7 patsienti paranes ja nad vabastati.
39 CR-hmKP isolaati jagati kahte rühma vastavalt kleepuva stringi pikkusele.Nende hulgas jagati ühte rühma 20 CR-hmKP isolaati viskoosse nööri pikkusega ≤ 25 mm ja 19 CR-hmKP isolaati viskoosse stringi pikkusega> 25 mm teise rühma.PCR meetod tuvastab virulentsusega seotud geenide rmpA, rmpA2, iutA ja iucA positiivse määra.CR-hmKP virulentsusega seotud geenide positiivsed määrad kahes rühmas on näidatud tabelis 2. CR-hmKP virulentsusega seotud geenide positiivsete sageduste osas kahe rühma vahel ei esinenud statistilist erinevust.
Tabelis 3 on loetletud 16 ravimi üksikasjalikud antimikroobse resistentsuse profiilid.16 CR-hvKP isolaadil ilmnes mitme ravimi suhtes resistentsus.Kõiki isolaate töödeldi ampitsilliini, ampitsilliini/sulbaktaami, tsefoperasooni/sulbaktaami, piperatsilliini/tasobaktaami, tsefasoliini, tsefuroksiimi, tseftasidiimi, tseftriaksooni, tsefepiimi, tsefoksitiini, imipeneemi ja meropeneemiga.Madalaim resistentsus oli trimetoprimsulfametoksasoolil (43,8%), millele järgnesid amikatsiin (62,5%), gentamütsiin (68,8%) ja tsiprofloksatsiin (87,5%).
16 CR-hvKP isolaadi virulentsusega seotud geenide, antimikroobse resistentsuse geenide, kapsli serotüübi geenide ja MLST jaotus on näidatud joonisel 1. Mõnede virulentsusega seotud geenide, antimikroobse resistentsuse geenide ja kapsli serotüübi geenide agaroosgeelelektroforeesi tulemused on näidatud joonisel 1. Joonis 2. MLST analüüs näitab kokku 3 ST-d, ST11 on kõige domineerivam ST (87,5%, 14/16), millele järgneb ST23 (6,25%, 1/16) ja ST86 (6,25%, 1). /16).Wzi tüpiseerimise tulemuste kohaselt tuvastati 4 erinevat kapsli serotüüpi (joonis 1).16 karbapeneemi suhtes resistentse hvKP isolaadi hulgas on K64 kõige levinum serotüüp (n=13), millele järgnevad K1 (n=1), K2 (n=1) ja K47 (n=1).Lisaks on kapsli serotüübi K1 tüvi ST23, kapsli serotüübi K2 tüvi ST86 ning ülejäänud 13 K64 tüve ja 1 tüvi K47 on kõik ST11.9 virulentsusgeeni positiivsed määrad 16 CR-hvKP isolaadis on näidatud joonisel 1. Virulentsusega seotud geenid entB, fimH, rmpA2, iutA ja iucA esinevad 16 CR-hvKP tüves, millele järgneb mrkD (n = 14), rmpA (n = 13), aerobakteriin (n = 2), AllS (n = 1).Kõik 16 CR-hvKP isolaati kannavad karbapenemaasi geeni blaKPC-2 ja laiendatud spektriga β-laktamaasi geeni blaSHV.16 CR-hvKP isolaati ei kandnud karbapeneemi geene blaNDM, blaVIM, blaIMP, blaOXA-48 ja laiendatud spektriga β-laktamaasi geene blaTEM, blaCTX-M-2 rühma ja blaCTX-M-8 rühma.16 CR-hvKP tüvest kandsid 5 tüve laiendatud spektriga β-laktamaasi geeni blaCTX-M-1 rühma ja 6 tüve laiendatud spektriga β-laktamaasi geeni blaCTX-M-9 rühma.
Joonis 1 16 CR-hvKP isolaadi virulentsusega seotud geenid, antimikroobse resistentsuse geenid, kapsli serotüübi geenid ja MLST.
Joonis 2 Mõnede virulentsusega seotud geenide, antimikroobse resistentsuse geenide ja kapsli serotüübi geenide elektroforees agaroosgeelil.
Märkus: M, DNA marker;1, blaKPC (893 bp);2, entB (400 bp);3, rmpA2 (609 bp);4, rmpA (429 bp);5, iucA (239 bp);6, iutA (880 bp);7, Aerobacterin (556 bp);8, K1 (1283 bp);9, K2 (641 bp);10, kõik S (508 bp);11, mrkD (340 bp);12, fimH (609 bp).
ERIC-PCR-i kasutati 16 CR-hvKP isolaadi homoloogia analüüsimiseks.Pärast PCR amplifikatsiooni ja agaroosgeelelektroforeesi on 3-9 DNA fragmenti.Sõrmejälgede võtmise tulemused näitasid, et 16 CR-hvKP isolaati olid väga polümorfsed ja isolaatide vahel olid ilmsed erinevused (joonis 3).
Viimastel aastatel on üha rohkem teateid CR-hvKP isolaatide kohta.CR-hvKP isolaatide ilmumine kujutab endast suurt ohtu rahvatervisele, kuna need võivad tervetel inimestel põhjustada tõsiseid, raskesti ravitavaid infektsioone.Selles uuringus uuriti CR-hvKP levimust ja molekulaarseid epidemioloogilisi omadusi Shanghai kolmanda taseme haiglas aastatel 2019–2020, et hinnata, kas selles valdkonnas on CR-hvKP puhangu oht ja selle arengusuund.Samal ajal võib see uuring anda põhjalikuma hinnangu kliinilisele nakkavusele, millel on suur tähtsus selliste isolaatide edasise leviku tõkestamisel.
Selles uuringus analüüsiti tagasiulatuvalt CR-hvKP kliinilist levikut ja suundumust aastatel 2019–2020. Aastatel 2019–2020 näitasid CR-hvKP isolaadid kasvutendentsi.2019. aastal eraldati ligikaudu 31,2% (5/16) CR-hvKP-st ja 2020. aastal 68,8% (11/16) CR-hvKP-st, mis on kooskõlas kirjanduses kirjeldatud CR-hvKP tõusutrendiga.Kuna Zhang et al.CR-hvKP-d kirjeldati esmakordselt 2015. aastal,10 on avaldatud üha rohkem CR-hvKP-alast kirjandust, 17-20 peamiselt Aasia ja Vaikse ookeani piirkonnas, eriti Hiinas.CR-hvKP on superbakter, millel on super virulentsus ja mitme ravimiresistentsus.See on kahjulik inimeste tervisele ja selle suremus on kõrge.Seetõttu tuleks tähelepanu pöörata ja võtta kasutusele meetmed selle leviku tõkestamiseks.
16 CR-hvKP isolaadi antibiootikumiresistentsuse analüüs näitas kõrget antibiootikumiresistentsuse määra.Kõiki isolaate töödeldi ampitsilliini, ampitsilliini/sulbaktaami, tsefoperasooni/sulbaktaami, piperatsilliini/tasobaktaami, tsefasoliini, tsefuroksiimi, tseftasidiimi, tseftriaksooni, tsefepiimi, tsefoksitiini, imipeneemi ja meropeneemiga.Madalaim resistentsus oli trimetoprimsulfametoksasoolil (43,8%), millele järgnesid amikatsiin (62,5%), gentamütsiin (68,8%) ja tsiprofloksatsiin (87,5%).Lingling Zhani ja teiste uuritud CR-hmkp resistentsuse määr on sarnane selle uuringuga [12].CR-hvKP-ga nakatunud patsientidel on palju põhihaigusi, madal immuunsus ja nõrk iseseisev steriliseerimisvõime.Seetõttu on antimikroobse tundlikkuse testi tulemuste põhjal õigeaegne ravi väga oluline.Vajadusel saab nakatunud koha leida ja ravida drenaaži, puhastamise ja muude meetoditega.
39 CR-hmKP isolaati jagati kahte rühma vastavalt kleepuva stringi pikkusele.Nende hulgas jagati ühte rühma 20 CR-hmKP isolaati viskoosse nööri pikkusega ≤ 25 mm ja 19 CR-hmKP isolaati viskoosse stringi pikkusega> 25 mm teise rühma.Võrreldes CR-hmKP virulentsusega seotud geenide positiivseid määrasid kahe rühma vahel, ei ilmnenud kahe rühma vahel statistiliselt olulist erinevust virulentsusgeenide positiivsetes määrades.Lin Ze et al.näitas, et Klebsiella pneumoniae virulentsuse geenide positiivne määr oli oluliselt kõrgem kui klassikalise Klebsiella pneumoniae omal.21 Siiski jääb ebaselgeks, kas virulentsusgeenide positiivne määr on positiivses korrelatsioonis kleepuva ahela pikkusega.Teised uuringud on näidanud, et klassikaline Klebsiella pneumoniae võib olla ka väga virulentne Klebsiella pneumoniae, millel on suurem virulentsusgeenide positiivne määr.22 Selles uuringus leiti, et CR-hmKP virulentsuse geeni positiivne määr ei ole positiivses korrelatsioonis lima pikkusega.String (või ei suurene kleepuva nööri pikkusega).
Selle uuringu ERIC PCR-i sõrmejäljed on polümorfsed ja patsientide vahel puudub kliiniline ristumine, seega on 16 CR-hvKP infektsiooniga patsienti juhuslikud.Varem on enamik CR-hvKP põhjustatud nakkusi teatatud üksikute või juhuslike juhtumitena, 23, 24 ja väikesemahulised CR-hvKP puhangud on kirjanduses haruldased.11,25 ST11 on Hiinas CRKP ja CR-hvKP isolaatides kõige levinum ST11.26,27 Kuigi ST11 CR-hvKP moodustas selles uuringus 87,5% (14/16) 16 CR-hvKP isolaadist, ei saa eeldada, et 14 ST11 CR-hvKP tüve on samast kloonist, seega ERIC PCR sõrmejälgede võtmine. on vajalik.Homoloogia analüüs.
Selles uuringus tehti kõigile CR-hvKP-ga nakatunud 16 patsiendile invasiivne operatsioon.Aruannete kohaselt näitab CR-hvKP11 põhjustatud ventilaatoriga seotud kopsupõletiku surmaga lõppenud puhang, et invasiivsed protseduurid võivad suurendada CR-hvKP infektsiooni riski.Samal ajal on CR-hvKP-ga nakatunud 16 patsiendil põhihaigused, millest enim esinevad ajuveresoonkonna haigused.Eelmine uuring näitas, et tserebrovaskulaarne haigus on CR-hvKP infektsiooni oluline sõltumatu riskitegur.28 Selle nähtuse põhjuseks võib olla tserebrovaskulaarse haigusega patsientide nõrgenenud immuunsus, patogeenseid baktereid ei saa iseseisvalt välistada ja tuginetakse ainult nende bakteritsiidsele toimele.Antibiootikumid põhjustavad pikas perspektiivis mitme ravimiresistentsuse ja hüpervirulentsuse kombinatsiooni.16 patsiendi hulgast suri 9 ja suremus oli 56,3% (9/16).Varasemates uuringutes on suremuskordaja kõrgem kui 10,12 ja varasemates uuringutes väiksem kui 11,21.16 patsiendi keskmine vanus oli 83,1 ± 10,5 aastat, mis näitab, et eakad on CR-hvKP suhtes vastuvõtlikumad.Varasemad uuringud on näidanud, et noored on nakkustele vastuvõtlikumad.Klebsiella pneumoniae virulentsus.29 Teised uuringud on aga näidanud, et eakad on vastuvõtlikud väga virulentsele Klebsiella pneumoniae'le24,28.See uuring on sellega kooskõlas.
16 CR-hvKP tüve hulgas, välja arvatud üks ST23 CR-hvKP ja üks ST86 CR-hvKP, on ülejäänud 14 tüve kõik ST11 CR-hvKP.ST23 CR-hvKP-le vastav kapsli serotüüp on K1 ja ST86 CR-HVKP vastav kapsli serotüüp on K2, sarnaselt varasematele uuringutele.30–32 ST23 (K1) CR-hvKP või ST86 (K2) CR-hvKP-ga nakatunud patsienti suri ja suremuskordaja (100%) oli oluliselt kõrgem kui ST11 CR-hvKP-ga nakatunud patsientidel (50%).Nagu on näidatud joonisel 1, on virulentsusega seotud geenide ST23 (K1) või ST86 (K2) tüvede positiivne määr kõrgem kui ST11 (K64) tüvede puhul.Suremus võib olla seotud virulentsusega seotud geenide positiivse määraga.Selles uuringus kannavad 16 CR-hvKP tüve karbapenemaasi geeni blaKPC-2 ja laiendatud spektriga β-laktamaasi geeni blaSHV.blaKPC-2 on Hiinas CR-hvKP kõige levinum karbapenemaasi geen.33 Zhao jt uuringus on 25blaSHV kõrgeima positiivse määraga laiendatud spektriga β-laktamaasi geen.Virulentsusgeenid entB, fimH, rmpA2, iutA ja iucA esinevad kõigis 16 CR-hvKP isolaadis, millele järgnevad mrkD (n=14), rmpA (n=13), anaerobitsiin (n=2), allS (n= 1), mis on sarnane eelmisele uuringule.34 Mõned uuringud on näidanud, et rmpA ja rmpA2 (lima fenotüübi geenide modulaatorid) võivad soodustada kapslite polüsahhariidide sekretsiooni, põhjustades hüpermukoidseid fenotüüpe ja suurenenud virulentsust.35 Aerobakteriine kodeerib iucABCD geen ja nende homoloogseid retseptoreid kodeerib iutA geen, seega on neil G. mellonella infektsiooni testis kõrgem virulentsuse tase.allS on K1-ST23 marker, mitte pLVPK-s, pLVPK on K2 supervirulentsuse tüüpi virulentsusplasmiid.allS on HTH tüüpi transkriptsiooni aktivaator.Need virulentsuse geenid aitavad teadaolevalt kaasa virulentsuse tekkele ning vastutavad koloniseerimise, invasiooni ja patogeensuse eest.36
See uuring kirjeldab CR-hvKP levimust ja molekulaarset epidemioloogiat Shanghais, Hiinas.Kuigi CR-hvKP põhjustatud nakkus on juhuslik, suureneb see aasta-aastalt.Tulemused toetavad varasemaid uuringuid ja näitavad, et ST11 CR-hvKP on Hiinas kõige populaarsem CR-hvKP.ST23 ja ST86 CR-hvKP näitasid kõrgemat virulentsust kui ST11 CR-hvKP, kuigi mõlemad on väga virulentsed Klebsiella pneumoniae.Kuna kõrge virulentse Klebsiella pneumoniae protsent suureneb, võib Klebsiella pneumoniae vastupanuvõime väheneda, mis toob kliinilises praktikas kaasa pimeda optimismi.Seetõttu on vaja uurida Klebsiella pneumoniae virulentsust ja ravimiresistentsust.
Selle uuringu kiitis heaks Shanghai viienda rahvahaigla meditsiinieetika komitee (nr 104, 2020).Kliinilised proovid on osa tavapärastest haigla laboriprotseduuridest.
Täname kõiki Shanghai viienda rahvahaigla kesklabori töötajaid selle uuringu tehniliste juhiste andmise eest.
Seda tööd toetas Shanghai Minhangi piirkonna loodusteaduste sihtasutus (kinnitusnumber: 2020MHZ039).
1. Navon-Venezia S, Kondratyeva K, Carattoli A. Klebsiella pneumoniae: peamine ülemaailmne antibiootikumiresistentsuse allikas ja süstik.FEMS Microbiology läbivaadatud väljaanne 2017;41(3): 252–275.doi: 10.1093/femsre/fux013
2. Prokesch BC, TeKippe M, Kim J jne. Kõrge toksilisuse põhjustatud primaarne osteomüeliit.Lancet on nakatunud Dis.2016;16(9):e190–e195.doi:10.1016/S1473-3099(16)30021-4
3. Shon AS, Bajwa RPS, Russo TA.Kõrge virulentsus (super lima).Klebsiella pneumoniae virulentsus.2014;4(2): 107–118.doi:10.4161/viru.22718
4. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: jätkake rünnakut tugeva kaitsega.Microbiol Mol Biol Rev. 2016;80(3):629–661.doi:10.1128/MMBR.00078-15
5. Fang C, Chuang Y, Shun C jt.Klebsiella pneumoniae uued virulentsusgeenid, mis põhjustavad primaarset maksaabstsessi ja sepsise metastaatilisi tüsistusi.J Exp Med.2004;199(5):697–705.doi:10.1084/jem.20030857
6. Russo TA, Olson R, Fang CT jne. J Clin Microbioli identifitseerimine, biomarker, mida kasutatakse väga virulentse Klebsiella pneumoniae eristamiseks klassikalisest Klebsiella pneumoniaest.2018;56(9):e00776.
7. YCL, Cheng DL, Lin CL.Klebsiella pneumoniae maksa abstsess, mis on seotud nakkusliku endoftalmiidiga.Arch intern arst.1986;146(10):1913-1916.doi:10.1001/archinte.1986.00360220057011
8. Chiu C, Lin D, Liaw Y. Metastaatiline septiline endoftalmiit mädase maksa abstsessi korral.J Kliiniline gastroenteroloogia.1988;10(5):524–527.doi:10.1097/00004836-198810000-00009
9. Guo Yan, Wang Shun, Zhan Li jne. Hiinas invasiivsete infektsioonidega seotud kõrge limaskestaga Klebsiella pneumoniae isolaatide mikrobioloogilised ja kliinilised omadused.Eelrakud on nakatunud mikroorganismidega.2017;7.
10. Zhang Yi, Zeng Jie, Liu Wei jne. Karbapeneemi suhtes resistentse Klebsiella pneumoniae väga virulentse tüve ilmnemine kliinilistes infektsioonides Hiinas[J].J infektsioon.2015;71(5): 553–560.doi:10.1016/j.jinf.2015.07.010
11. Gu De, Dong Nan, Zheng Zhong jne. ST11 karbapeneemi suhtes resistentse kõrge virulentsusega Klebsiella kopsupõletiku surmav puhang Hiina haiglas: molekulaarne epidemioloogiline uuring.Lancet on nakatunud Dis.2018;18(1):37–46.doi:10.1016/S1473-3099(17)30489-9
12. Zhan Li, Wang S, Guo Yan jt.Karbapeneemi suhtes resistentse tüve ST11 hüpermukoidse Klebsiella pneumoniae puhang Hiina kolmanda taseme haiglas.Eelrakud on nakatunud mikroorganismidega.2017;7.
13. FRE, Messai Y, Alouache S jne. Klebsiella pneumoniae virulentsusspekter ja erinevatest kliinilistest proovidest eraldatud ravimitundlikkuse mudel[J].Patofüsioloogia.2013;61(5):209-216.doi:10.1016/j.patbio.2012.10.004
14. Turton JF, Perry C, Elgohari S jne. Klebsiella pneumoniae PCR iseloomustus ja tüpiseerimine, kasutades kapslitüübi spetsiifilisust, muutuvat tandemkorduste arvu ja virulentsusgeeni sihtmärke [J].J Med Microbiology.2010;59 (5. peatükk): 541–547.doi:10.1099/jmm.0.015198-0
15. Brisse S, Passet V, Haugaard AB jne. Wzi geenide sekveneerimine, kiire meetod Klebsiella kapsli tüübi määramiseks[J].J Kliiniline mikrobioloogia.2013;51(12):4073-4078.doi:10.1128/JCM.01924-13
16. Ranjbar R, Tabatabaee A, Behzadi P jne. Erinevatest loomade väljaheiteproovidest eraldatud E. coli tüved, enterobakterite korduva geenitüübi määramise konsensuspolümeraasi ahelreaktsiooni (ERIC-PCR) genotüpiseerimine[J].Iraan J Pathol.2017;12(1): 25–34.doi:10.30699/ijp.2017.21506


Postitusaeg: 15. juuli 2021