Covid-19 testi tundlikkuse ümbermõtestamine –?Piiramisstrateegia

Kasutage NEJM Groupi teavet ja teenuseid, et valmistuda arstiks, koguda teadmisi, juhtida tervishoiuorganisatsiooni ja edendada oma karjääri.
On aeg muuta oma arvamust Covid-19 testi tundlikkusest.USA toidu- ja ravimiamet (FDA) ja teadusringkonnad keskenduvad praegu peaaegu eranditult tuvastamise tundlikkusele, mis mõõdab ühe tuvastamismeetodi võimet tuvastada viirusvalke või RNA molekule.Oluline on see, et see meede eirab testi kasutamise konteksti.Kui aga rääkida laialt levinud sõelumisest, mida USA hädasti vajab, on kontekst ülioluline.Võtmeküsimus pole mitte see, kui head molekuli saab ühest proovist tuvastada, vaid kas nakkust saab populatsioonis tõhusalt tuvastada, kasutades antud testi taaskasutades üldise avastamisstrateegia osana?Katseplaani tundlikkus.
Tavalised testimisprogrammid võivad toimida omamoodi Covid-19 filtrina, tuvastades, isoleerides ja filtreerides välja hetkel nakatunud inimesed (sh asümptomaatilised inimesed).Testiplaani või filtri tundlikkuse mõõtmine eeldab, et me kaalume testi kontekstis: kasutussagedus, kes kasutab, millal see nakatumisprotsessi ajal toimib ja kas see on efektiivne.Tulemused tagastatakse õigeaegselt, et vältida levikut.1-3
Inimese nakatumise trajektoori (sinine joon) näidatakse kahe erineva analüütilise tundlikkusega seireprogrammi (ringi) kontekstis.Sageli tehakse madala analüütilise tundlikkusega teste, samas kui kõrge analüütilise tundlikkusega analüüse on harva.Mõlemad testimisskeemid suudavad tuvastada infektsiooni (oranž ring), kuid vaatamata selle madalamale analüütilisele tundlikkusele suudab ainult kõrgsagedustest tuvastada selle levikuaknas (vari), mis muudab selle tõhusamaks filtriseadmeks.Polümeraasi ahelreaktsiooni (PCR) tuvastamise aken (roheline) enne nakkavust on väga lühike ja vastav aken (lilla), mida saab pärast nakatumist PCR-iga tuvastada, on väga pikk.
Korduva kasutamise mõjudele mõtlemine on arstidele ja reguleerivatele asutustele tuttav mõiste;seda kasutatakse alati, kui mõõdame raviplaani, mitte ühe annuse efektiivsust.Seoses Covid-19 juhtumite kiirenenud arengu või stabiliseerumisega kogu maailmas peame kiiresti suunama oma tähelepanu kitsalt tähelepanult testi analüütilisele tundlikkusele (selle alumisele piirile, mille abil saab õigesti tuvastada väikeste molekulide kontsentratsiooni proovis ) ja test Programm on seotud nakkuste tuvastamise tundlikkusega (nakatunud isikud mõistavad õigeaegselt nakatumise võimalust, et nad populatsioonist välja filtreerida ja teistele levikut vältida).Hoolduskoha test, mis on piisavalt odav ja mida saab sageli kasutada, on kõrge tundlikkusega nakkuste tuvastamiseks, mis võtavad õigeaegselt meetmeid, ilma et peaksid jõudma algtaseme testi analüütilise piirini (vt joonist).
Vajalikud testid erinevad põhimõtteliselt praegu kasutatavatest kliinilistest testidest ja neid tuleb hinnata erinevalt.Kliiniline test on mõeldud sümptomitega inimestele, ei nõua madalaid kulusid ja nõuab suurt analüütilist tundlikkust.Kuni on testimisvõimalus, saab kindla kliinilise diagnoosi tagasi panna.Seevastu tõhusate seireprogrammide testid hingamisteede viiruste levimuse vähendamiseks elanikkonnas peavad andma kiiresti tulemused, et piirata asümptomaatiline levikut, ning need peaksid olema piisavalt odavad ja hõlpsasti teostatavad, et võimaldada sagedast testimist – mitu korda nädalas.SARS-CoV-2 levik näib aset leidvat mõni päev pärast kokkupuudet, kui viiruskoormus jõuab haripunkti.4 See ajahetk suurendab kõrge testimise sageduse tähtsust, sest testimist tuleb kasutada nakkuse alguses, et vältida levikut ja vähendada standardse testimise väga madala molekulaarse piiri saavutamise tähtsust.
Mitme kriteeriumi kohaselt ebaõnnestub standardne kliinilise polümeraasi ahelreaktsiooni (PCR) test, kui seda kasutatakse järelevalveprotokollides.Pärast kogumist tuleb PCR-proovid tavaliselt transportida ekspertidest koosnevasse tsentraliseeritud laborisse, mis suurendab kulusid, vähendab sagedust ja võib tulemuste saamise ühe kuni kahe päeva võrra edasi lükata.Standardtestidega testimiseks kuluv kulu ja pingutus tähendab, et enamikku USA-s elavatest inimestest pole kunagi testitud ning lühike läbimisaeg tähendab, et isegi kui praeguste seiremeetoditega saab nakatunud isikuid tõepoolest tuvastada, võivad nad nakkust mitu päeva siiski levitada.Varem piiras see karantiini ja kontaktide jälgimise mõju.
Haiguste tõrje ja ennetamise keskused (CDC) prognoosivad, et 2020. aasta juuniks on Ameerika Ühendriikides avastatud Covid-19 juhtumite arv avastatud juhtude arvust kümme korda suurem.5 Teisisõnu, vaatamata jälgimisele suudavad tänapäevased testimisskeemid tuvastada maksimaalselt 10% tundlikkust ja neid ei saa kasutada Covidi filtrina.
Peale selle on pärast ülekandumise staadiumit selgelt kirjeldatud RNA-positiivset pikka saba, mis tähendab, et kui mitte enamik, siis paljud inimesed kasutavad rutiinse jälgimise käigus infektsiooni tuvastamiseks kõrget analüütilist tundlikkust, kuid nad ei ole tuvastamise ajal enam nakkav. .Tuvastamine (vt pilti).2 Tegelikult näitas The New York Timesi hiljutine uuring, et Massachusettsis ja New Yorgis on enam kui 50% PCR-põhise seire käigus avastatud infektsioonidest PCR-i tsükli lävi 30-30ndate keskel., mis näitab, et viiruse RNA arv on madal.Kuigi madalad arvud võivad viidata varasele või hilisele infektsioonile, näitab RNA-positiivsete sabade pikem kestus, et enamik nakatunud inimesi on tuvastatud pärast nakatumisperioodi.Majanduse jaoks ülioluline tähendab see ka seda, et kuigi nad on läbinud nakkusliku ülekandefaasi, on tuhanded inimesed pärast RNA-positiivset testi endiselt 10 päeva karantiinis.
Selle pandeemilise Covidi filtri tõhusaks peatamiseks peame seda testima, et võimaldada lahendus, mis püüab kinni enamiku nakkustest, kuid on siiski nakkav.Tänapäeval on need testid olemas kiire külgvoolu antigeenitestide kujul ja CRISPR-i geenide redigeerimise tehnoloogial põhinevad kiire külgvoolu testid on ilmumas.Sellised testid on väga odavad (<5 USD), iga nädal saab teha kümneid miljoneid ja enamgi teste ning neid saab teha ka kodus, avades ukse tõhusale Covidi filtreerimislahendusele.Lateraalse voolu antigeeni testil ei ole amplifikatsioonietappi, seega on selle avastamispiir 100 või 1000 korda suurem kui etalontestil, kuid kui eesmärk on tuvastada inimesi, kes praegu viirust levitavad, on see suures osas ebaoluline.SARS-CoV-2 on viirus, mis võib organismis kiiresti kasvada.Seega, kui PCR-testi võrdlustulemus on positiivne, kasvab viirus eksponentsiaalselt kiiresti.Selleks ajaks võib kuluda tunde, mitte päevi, enne kui viirus kasvab ja jõuab praegu saadaoleva odava ja kiire kiirtestimise avastamisläveni.Pärast seda, kui inimesed saavad mõlemas testis positiivse tulemuse, võib eeldada, et nad on nakkusohtlikud (vt joonist).
Usume, et seire testimisprogrammid, mis suudavad kogukonna leviku vähendamiseks katkestada piisavalt ülekandeahelaid, peaksid pigem täiendama kui asendama meie praeguseid kliinilisi diagnostilisi teste.Kujutlusvõimeline strateegia võib neid kahte testi ära kasutada, kasutades puhangute vähendamiseks suuremahulisi, sagedasi, odavaid ja kiirteste, 1-3 kasutades teist kiirtesti erinevate valkude jaoks või kasutades positiivse tulemuse kinnitamiseks PCR-testi.Üldsuse teadlikkuse tõstmise kampaania peab edastama ka igasuguse negatiivse testiarve, mis ei viita tingimata tervisele, et julgustada sotsiaalset distantseerumist ja maskide kandmist.
FDA Abbott BinaxNOW hädaolukorra kasutamise luba (EUA) augusti lõpus on samm õiges suunas.See on esimene kiire ja instrumendivaba antigeenitest EUA saamiseks.Heakskiitmise protsess rõhutab testi suurt tundlikkust, mille abil saab kindlaks teha, millal on inimestel kõige suurem tõenäosus nakkust levitada, vähendades seeläbi nõutavat avastamispiiri kahe suurusjärgu võrra võrreldes PCR-i võrdlusalusega.Need kiirtestid tuleb nüüd välja töötada ja koduseks kasutamiseks heaks kiita, et saavutada SARS-CoV-2 jaoks tõeline kogu kogukonda hõlmav seireprogramm.
Praegu ei ole FDA-l ühtegi võimalust, mis hindaks ja kinnitaks testi kasutamiseks raviplaanis, mitte ühe testina, ning puudub rahvatervise potentsiaal kogukonna leviku vähendamiseks.Reguleerivad asutused keskenduvad endiselt ainult kliinilistele diagnostilistele testidele, kuid kui nende eesmärk on vähendada viiruse levimust kogukonnas, saab epidemioloogilisel raamistikul põhinevatele hindamistestidele rakendada uusi näitajaid.Selle heakskiitmise lähenemisviisi puhul saab prognoosida ja asjakohaselt hinnata kompromisse sageduse, avastamispiiri ja pöördeaja vahel.1-3
Covid-19 võitmiseks usume, et FDA, CDC, riiklikud tervishoiuinstituudid ja teised agentuurid peavad julgustama testide struktureeritud hindamist kavandatud testimisprogrammide kontekstis, et välja selgitada, milline testimisprogramm suudab pakkuda parimat Covid-filtrit.Sage odavate, lihtsate ja kiirete testide kasutamine võib selle eesmärgi saavutada, isegi kui nende analüütiline tundlikkus on palju madalam kui võrdlustestide oma.1 Selline skeem võib aidata meil ka Covidi arengut ära hoida.
Bostoni Harvardi Chencheni rahvatervise kool (MJM);ja Colorado Boulderi Ülikool (RP, DBL).
1. Larremore DB, Wilder B, Lester E jne. COVID-19 seire puhul on testi tundlikkus sageduse ja tööaja järel teisel kohal.8. september 2020 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.06.22.20136309v2).Eeltrükk.
2. Paltiel AD, Zheng A, Walensky RP.Hinnake SARS-CoV-2 sõelumisstrateegiat, et võimaldada Ameerika Ühendriikide ülikoolilinnakute ohutut taasavamist.JAMA Cyber ​​​​Open 2020;3(7): e2016818-e2016818.
3. Chin ET, Huynh BQ, Chapman LAC, Murrill M, Basu S, Lo NC.COVID-19 rutiinse testimise sagedus kõrge riskiga keskkondades, et vähendada töökoha puhanguid.9. september 2020 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.30.20087015v4).Eeltrükk.
4. He X, Lau EHY, Wu P jne. Viiruse leviku aja dünaamika ja COVID-19 ülekandevõime.Nat Med 2020;26:672-675.
5. Haiguste tõrje ja ennetamise keskused.CDC uuendatud telefonibriifingu ärakiri COVID-19 kohta.25. juuni 2020 (https://www.cdc.gov/media/releases/2020/t0625-COVID-19-update.html).
Inimese nakatumise trajektoori (sinine joon) näidatakse kahe erineva analüütilise tundlikkusega seireprogrammi (ringi) kontekstis.Sageli tehakse madala analüütilise tundlikkusega teste, samas kui kõrge analüütilise tundlikkusega analüüse on harva.Mõlemad testimisskeemid suudavad tuvastada infektsiooni (oranž ring), kuid vaatamata selle madalamale analüütilisele tundlikkusele suudab ainult kõrgsagedustest tuvastada selle levikuaknas (vari), mis muudab selle tõhusamaks filtriseadmeks.Polümeraasi ahelreaktsiooni (PCR) tuvastamise aken (roheline) enne nakkavust on väga lühike ja vastav aken (lilla), mida saab pärast nakatumist PCR-iga tuvastada, on väga pikk.


Postitusaeg: 11.03.2021